Red & Blue:

Los personajes jugables (1-2 players respectivamente). Gemelos, hermanos menores de Green, y -previsiblemente- mayores que Yellow. Poco peso relativo en la historia (si obviamos que se dedican a masacrar a cada soldado o Jefe de El Imperio que encuentran a su paso), Treasure no les dotó de la personalidad y habilidades distintivas que ostentan sus futuros “descendientes”. Simples instrumentos para la inmersión del jugador.

Green:

El hermano mayor de la familia y actualmente considerado el Gunstar más poderoso. Conoce la ubicación de las gemas, y tenerlo de su lado, es por tanto la llave que permitirá a El Imperio llevar a cabo su plan. Víctima de una emboscada, Smash Daisaku consigue reclutarle gracias a una máquina de control mental y ahora está a las órdenes del General Gray. Sólo él puede controlar a Seven Force, un gigantesco y legendario mecha casi invencible capaz de adoptar siete fuerzas diferentes de ataque, y que Green habitualmente utiliza como medio de transporte.

Professor White Gunstar / Dr. Brown:

Antaño un héroe, se cuenta que consiguió desactivar a Golden Silver y evitar la destrucción de Gunstar 9. Ahora es un anciano incapaz de luchar. No está claro el grado de parentesco que le une a los Gunstars, aunque de haberlo, es posiblemente el abuelo de éstos. Optimista y desinhibido, se convierte en su mentor y les concede apoyo logístico mientras desarrolla todo tipo de mecanismos, como la famosa pistola Gunstar o los vagones modificados para atravesar la mina.

Yellow:

Operadora en el Cuartel General Gunstar, es la hermana menor de la familia. No presenta ninguna habilidad para el combate y por lo tanto es vulnerable. Está muy preocupada por Green y el futuro del planeta Gunstar 9.

Smash Daisaku:

Un enloquecido villano ansioso de venganza. Creador de diversos artilugios, ha modificado su cuerpo y porta un traje especial equipado con un propulsor que le permite volar y estirar algunas de sus extremidades. Se ha convertido en la mano derecha del General Gray y colabora con El Imperio principalmente para deshacerse de una vez por todas de los Gunstars, a los que conoce bien.

General Gray:

El líder de El Imperio. Está convencido de que el regreso de God of Ruin traerá consigo al creador del “nuevo mundo”, un renacer del que él espera sacar partido, y un movimiento que le permitiría gobernar Gunstar 9, y el universo. Con la posesión de las gemas, ha reclutado el mayor ejército del planeta.

Golden Silver:

La amenaza latente a lo largo del juego. De origen desconocido, es un androide milenario programado únicamente para succionar la energía de todos los planetas que encuentre a su paso. Obtiene su poder de las 4 Gemas Místicas, que junto a Silver forman un todo, y cobran vida propia. No deben serle devueltas bajo ningún concepto.